Nucleic Acids Research
11 July 2022
خوارزمية تجميع التحويل وتطبيقها في التنميط الهيكلي للبوليريبوسومات
Wenhong Jiang1, Jonathan Wagner2,3, Wenjing Du1, Juergen Plitzko4, Wolfgang Baumeister2, Florian Beck4 and Qiang Guo1,5
1 مختبر الدولة الرئيسي لأبحاث البروتين والجينات النباتية، مركز بكين تسينغهوا لعلوم الحياة، أكاديمية الدراسات المتقدمة متعددة التخصصات، كلية علوم الحياة، جامعة بكين، بكين 100871، الصين،
2 قسم البيولوجيا الجزيئية الإنشائية، معهد ماكس بلانك للكيمياء الحيوية، أم كلوبفرسبيتز 18، 82152 مارتينسريد، ألمانيا،
3 قسم الكيمياء الحيوية الخلوية، معهد ماكس بلانك للكيمياء الحيوية، أم كلوبفرسبيتز 18، 82152 مارتينسريد، ألمانيا،
4 تقنية CryoEM، معهد ماكس بلانك للكيمياء الحيوية، آم كلوبفرسبيتز 18، 82152 مارتينسريد، ألمانيا،
5 مختبر تشانغبينغ، بكين، الصين
10.1093/نار/gkac547
أدت التحسينات في إعداد عينات التصوير المقطعي الإلكتروني بالتبريد، وأدوات الفحص المجهري الإلكتروني، وخوارزميات معالجة الصور إلى تقدم التحليل الهيكلي للجزيئات الكبيرة في الموقع. وبعيدًا عن مثل هذه التحليلات للجزيئات الكبيرة الفردية، فإن دراسة تفاعلاتها مع جيرانها المرتبطين وظيفيًا في الموائل الخلوية المزدحمة، أي "علم الاجتماع الجزيئي"، لها أهمية أساسية في علم الأحياء. نقدم هنا خوارزمية تجميع الجزيئات المجاورة (NEMO-TOC). لقد قمنا بتحسين هذه الخوارزمية للكشف عن متعددات الريبوسومات وتوصيفها، والتي تلعب أدوارًا تأسيسية وتنظيمية في التعبير الجيني. تشير نتائجنا إلى نموذج تتشكل فيه الجسيمات المتعددة عن طريق ربط كتل غير عشوائية متعددة، ومن المحتمل أن تكون الترجمة فيها متزامنة.
ساعات عملنا
الإثنين 21/11 - الأربعاء 23/11: 9 صباحًا - 8 مساءً
الخميس 24/11: مغلق - عيد شكر سعيد!
الجمعة 25/11: 8 صباحًا - 10 مساءً
السبت 26/11 - الأحد 27/11: 10 صباحًا - 9 مساءً
(جميع الساعات بالتوقيت الشرقي)