Genetics and Genomics خدمة تصميم غلاف المجلات (GWAS)

Journal of Genetics and Genomics

3 February 2023

تمكن التحليلات الجينومية والنسخية من تحديد الجينات المهمة المرتبطة بترسب الدهون تحت الجلد في أبقار الهولشتاين

Hailiang Zhang^a,1, Siyuan Mi^a,1, Luiz F. Brito^b, Lirong Hu^a, Lei Wang^a, Longgang Ma^a, Qing Xu^c, Gang Guo^d, Ying Yu^a,*, Yachun Wang^a,*

10.1016/j.jgg.2023.01.011

الأهداف الرئيسية لهذه الدراسة هي تحديد الجينات المرشحة الرئيسية التي تنظم ترسب الدهون تحت الجلد في أبقار الألبان عالية الإنتاج من خلال دمج مجموعات البيانات الجينومية والنسخية. تم استخدام ما مجموعه 1654 بقرة هولشتاين وراثية لإجراء دراسة الارتباط على مستوى الجينوم (GWAS) بهدف تحديد الجينات المرتبطة بترسب الدهون تحت الجلد. بعد ذلك، يتم إجراء تحليلات شبكة التعبير الجيني المشترك (WGCNA) بناءً على بيانات تسلسل الحمض النووي الريبي (RNA) لـ 34 بقرة وانحرافات إنتاجية البقرة لترسب الدهون تحت الجلد. أخيرًا، تم الحصول على جينات الربط التفاضلي (DE) mRNA وlncRNA وجينات الربط البديلة التفاضلية لـ 12 بقرة هولشتاين ذات أنماط ظاهرية متطرفة ومتباينة لترسب الدهون تحت الجلد. بدمج جميع النتائج، تعتبر الجينات NID2، STARD3، UFC1، DEDD، PPP1R1B، وUSP21 من أهم الجينات المرشحة التي تؤثر على سمات ترسب الدهون تحت الجلد في أبقار الهولشتاين.